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    梁旭方教授課題組從全基因組角度揭示鱖魚的兇猛食性機制
    發布時間:2020-07-13

    圖1 翹嘴鱖捕食活餌料魚

    圖1 翹嘴鱖捕食活餌料魚

    圖2 比較基因組學研究

    圖2 比較基因組學研究

    近日,梁旭方教授課題組完成了鱖科4種魚類的基因組測序工作,并在Nature旗下期刊Communications Biology上發表了題為“Mandarin fish (Sinipercidae) genomes provide insights into innate predatory feeding”的研究論文。

    鱖科(Sinipercidae)魚類生性兇猛,自開食起即以其他魚類為食,通常拒食浮游動物或人工飼料。適口活餌料魚的穩定供應成為鱖魚產業發展的關鍵制約因素,用人工飼料替代活魚養鱖是產業健康可持續發展的必然選擇。梁旭方教授課題組主導并與德國萊布尼茨淡水生態與內陸漁業研究所(IGB)合作完成了翹嘴鱖(Siniperca chuatsi)基因組的三代測序及染色體水平組裝,以及大眼鱖(Siniperca kneri)、斑鱖(Siniperca scherzeri)和少鱗鱖(Coreoperca whiteheadi)高質量基因組組裝。通過比較基因組學分析揭示了鱖科魚類在兇猛食性、生長、幽門盲囊和鹽度適應等性狀上的快速適應性進化機制。

    鰓耙與魚類食性密切相關,鱖科魚類僅有4-9個鰓耙,少于其它魚類。鰓耙發育相關基因edar低表達可能是翹嘴鱖鰓耙數目少的原因。Edar-/-魚鰓耙缺失,對浮游動物的攝食減少,而對餌料魚的攝食增加。EDAR激活劑能夠促進鰓耙發育,更密的鰓耙有利于濾食浮游動物。bmp4高表達能夠通過結合edar上游的Xvent-1位點抑制edar表達和鰓耙發育,從而使得鱖魚更加兇猛。

    何珊副教授、博士研究生李玲和呂麗媛為論文共同第一作者,我校梁旭方教授和德國萊布尼茨淡水生態與內陸漁業研究所的Dr. Heiner Kuhl為論文通訊作者。

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